眾多耳熟能詳的食用菌、藥用菌和毒蘑菇，都是蘑菇目（Agaricales）的成員，該目真菌具有重要經濟價值和生態(tài)價值。前人將該目真菌劃分為8亞目、46科，然而一些科屬的系統(tǒng)位置以及科屬內的親緣關系并不清楚。例如，擬口蘑屬（Tricholomopsis）和元蘑屬（Sarcomyxa）真菌的系統(tǒng)位置就一直沒有定論。

與國內外同行合作，中國科學院昆明植物研究所真菌多樣性與分子進化專題組對全球擬口蘑屬、元蘑屬、大核瑚菌屬（Macrotyphula）、黃側耳屬（Phyllotopsis）等類群的真菌樣品開展了淺層基因組測序，結合數據庫中公開的蘑菇目其他某些物種的基因組數據，通過單拷貝直系同源基因提取、基因沖突檢測、系統(tǒng)發(fā)育樹構建、拓撲結構檢測等分析方法，基于555個單拷貝直系同源基因的氨基酸序列，重建了迄今解析度和分辨率最高的蘑菇目系統(tǒng)發(fā)育框架，明晰了多數亞目間的親緣關系，錨定了擬口蘑屬和元蘑屬的系統(tǒng)位置。該研究提出蘑菇目10亞目的新分類系統(tǒng)，對其中數個亞目的成員做了適當調整，正式發(fā)表2個新亞目（元蘑亞目Sarcomyxineae和黃褶菌亞目Phyllotopsidineae）、1個新屬（錐頭傘屬Conoloma）、2個新組和6個新種，解決了我國擬口蘑屬分類中的諸多問題，探討了該屬物種的基質偏好性和菌蓋表面鱗片演化規(guī)律。

該研究對進一步認識蘑菇目各大類群間的系統(tǒng)發(fā)育關系具有較重要的科學意義，成果發(fā)表在中國菌物學會的旗艦期刊Mycology上。昆明植物研究所博士研究生王庚申為論文第一作者，楊祝良研究員為通訊作者。該研究得到了云南省科技領軍人才項目（202305AB350004）等項目的資助。

圖1. 基于555個單拷貝直系同源基因構建的蘑菇目最大似然樹。節(jié)點數值為BS支持率，未標注數據的節(jié)點支持率為100%。

圖2. 擬口蘑屬Tricholomopsis部分物種的野外照片。a–b 草甸擬口蘑T. compestris；c 凹蓋擬口蘑T. depressa；d 火紅擬口蘑T. flammula；e 淡粉擬口蘑T. mitirubicunda；f 淡黃擬口蘑T. pallidolutea；g 赭紅擬口蘑T. rutilans；h 硫色擬口蘑T. sulfureoides；i 云南擬口蘑T. yunnanensis。比例尺=1 cm。

圖3. 擬口蘑屬基質偏好和蓋表鱗片祖先狀態(tài)重建。擬口蘑屬下各組名稱標注在對應的分支。

來源：中國科學院昆明植物研究所 作者：王庚申，楊祝良